Tenma Matsukaze y el renovado equipo Inazuma Japan participará en el torneo Football Frontier International Vision 2. Su objetivo es ganar, pero lo que no saben es que tienen un torneo más importante en el que participar. De repente, una nave espacial aparece ante ellos.La nave ha viajado 188.000 años liz con un mensaje: participad en el campeonato de fútbol Grand Celesta Galaxy, y si perdéis, la Tierra será destruida.
Este será el inicio de Inazuma Eleven Go Galaxy, la nueva entrega de la conocida franquicia de Level-5 que está vez pondrá el futuro de la mismísima Tierra en los pies de los jugadores de fútbol, que a su vez controlarán los jugadores.
Siguiendo la tradición, habrá dos títulos diferentes llamados Inazuma Eleven Go Galaxy: Big Bang eInazuma Eleven Go Galaxy: Super Nova. Ambas versiones se lanzarán en invierno de 2013 para Nintendo 3DS.